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首個石榴端粒到端粒參考基因組圖完成

   日期:2025-05-19     來源:中國農業科學院鄭州果樹研究所    瀏覽:21    
核心提示:首個石榴端粒到端粒參考基因組圖完成時間:2025-05-19 08:54來源:中國農業科學院鄭州果樹研究所作者: 陳利娜  近日,中國農業
                                                             首個石榴端粒到端粒參考基因組圖完成
放大字體  縮小字體時間:2025-05-19 08:54 來源:中國農業科學院鄭州果樹研究所 作者: 陳利娜 
    近日,中國農業科學院鄭州果樹研究所特色漿果與干果種質改良課題組揭示了石榴重要經濟性狀的遺傳機制。該研究組裝了首個石榴端粒到端粒參考基因組圖。鑒定了15個重要農藝性狀的相關聯位點。揭示了控制石榴果皮顏色和籽粒硬度形成的遺傳機制,建立了石榴基因編輯體系,為石榴分子育種體系的建立奠定了基礎。相關研究成果發表在(植物生物技術雜志《Plant Biotechnology Journal》)上。
 
  籽粒硬度和果皮顏色是決定石榴品質性狀的重要指標,解析石榴籽粒硬度和果皮顏色的遺傳機制可以為石榴果實品質遺傳改良提供重要理論依據。
 
  科研團隊采用多種組裝策略,完成了首個石榴端粒到端粒參考基因組圖譜,該基因組包含8條染色體,總長度為366,710,298個堿基對,預測編碼蛋白基因32,158個。發現了非典型端?;蚩赡茉谇丝莆锓N進化中發揮重要作用。依據全基因組關聯分析鑒定出15個重要農藝性狀的相關聯位點16個。其中,1號染色體上37,193個堿基對的易位打斷了石榴花色苷合成酶基因編碼序列,導致葉片、花朵和果實(果皮和籽粒)花青素缺失。石榴花色苷還原酶基因啟動子區域特有的重復序列擴增影響了其表達量進而導致紫色果皮的形成。控制石榴籽粒硬度基因的編碼區單堿基非同義突變影響其與下游轉錄因子啟動子的結合,進而影響石榴籽粒硬度。
 
  該研究得到了國家自然科學基金、中國農業科學院科技創新工程等項目的支持。
 
  原文鏈接:
 
  https://onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1111/pbi.70107
 
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